天命十一年（1626）七月二十三日，努尔哈赤染病，到清河温泉疗养。八月初七日，因病势沉重，决定返回沈阳，乘船顺太子河而下，同时派人召大福晋阿巴亥来见。阿巴亥所乘的船，在浑河上的叆鸡堡河段与努尔哈赤所乘的船相遇，准备随后一起赶往沈阳。然而，努尔哈赤再也没有回到沈阳，再也没有见到他的儿子和部属们。八月十一日未时（下午13-15时），六十七岁的努尔哈赤死在了浑河的船上，地址正在叆鸡堡，距离沈阳四十里。阿巴亥只能陪着丈夫的尸体返回皇宫。阿巴亥成了陪伴努尔哈赤最后一刻的唯一一人。
努尔哈赤至死都没有确立继承人，后金王位的归属，成了一个极大的问题。按照努尔哈赤生前曾经制定的“大汗共推”之说，皇太极被推举为新汗。然而，这位新汗此时所担忧的是阿巴亥作为努尔哈赤临终前唯一的陪伴者——假如这位大福晋对皇太极继位不满，说出什么不利于新汗的“遗言”、或者以她的正妻的名份再加上三个儿子手里的军队来图谋汗位呢？于是，一个阴谋出台了。
八月十二日寅（凌晨3-5时）时，代善宣布了皇太极继位的消息。刚死了丈夫的阿巴亥并没对这个消息做出任何反映，因为这毕竟是诸皇族共推之举。但是卯时（清晨5-7时）又一个消息被宣布：先帝早有遗命交代诸王——大福晋殉葬。
除了努尔哈赤疗养的短短十几天之外，阿巴亥一直跟随的丈夫身边，丈夫临终时也只有自己陪伴，他不可能、也没有时间见过这些王公，留下这样一条遗嘱。然而阿巴亥的哭叫和辩解没有任何作用，所有的成年王爷和大臣都赶到了她所住的宫室，各种各样的眼睛都紧紧地盯着她，恶狠狠的话也从这些道貌岸然的男人嘴里吐出来：“先帝有命，虽欲不从，不可得也。”
皇太极为什么不杀多尔衮 是不是阿巴亥的关系
当明白自己不可能逃脱死亡之后，阿巴亥恢复了神智，这时候她唯一的愿望，就是能够以自己的死确保三个儿子的平安。于是她更换了大福晋的礼服，佩戴上了自己所有的珠宝首饰，哭着向诸王请求：“吾自十二岁事先帝，丰衣美食，已二十六年。吾不忍离，故相从于地下。吾二幼子多尔衮多铎，当恩养之。”诸王这时也流下了鳄鱼的眼泪，当众一齐盟誓：“二幼弟，吾等若不恩养，是忘父也，岂有不恩养之理！”于是，36岁的阿巴亥自缢殉葬（也有说法是被弓弦勒死），她死的时间是当天早晨的辰时（上午7-9时），距努尔哈赤去世不到二十个小时、距返回沈阳刚一个晚上，距殉葬令公布还不到一个时辰。她死后与努尔哈赤同棺敛葬。巳时（上午9-11时），棺木便迅速成殓。（从逼她殉葬到把尸体装进棺材不过三四个小时）同殉者还有两位庶妃，其中包括那位德因泽。这也许是皇太极卸磨杀驴，又或者叫杀人灭口。
