这两种病毒的感染症状也比较类似——
SARS初期症状包括：咳嗽，发热，嗜睡，肌肉酸痛等，常伴随高烧不退，呼吸急促等症状;肺炎症状明显，重者转为肺纤维化，肺组织增厚，丧失换气能力。潜伏期一般在4-10天，临床报告最短病例为1天，最长有20天，甚至有极个别病例达到28天。
MERS的症状有发热、咳嗽、呼吸急促等。大多数住院患者出现发烧、发冷/寒颤、咳嗽、呼吸急促和肌肉疼痛等症状。有四分之一的患者同时表现出胃肠道症状，包括腹泻和呕吐。最大潜伏期是两周。
尽管MERS和SARS具有一些相似的临床特征(比如：发烧、咳嗽、潜伏期)，但二者之间也存在一些重要差异。
☆ 发病人群有差异
SRAS病毒更容易在医疗机构中和年轻人之间传播，与SARS相反，绝大多数MERS患者为患有慢性疾病的人群。参照埃及卫生和人口部发布的警告，除 了医务工作者，年龄在15岁以下的小孩和65岁以上的老人、孕妇、患有心血管、肺炎等慢性病和抵抗力较差的病人，都是易感人群。
☆ 临床进程有差异
MERS在短期内快速进展为呼吸衰竭，比SARS早至少5天。
☆ 传染性有差异
MERS病毒的传播能力并不强，比2003年SARS病毒和2009年甲型H1N1病毒都弱，可能是该病毒由动物感染到人之后，还没有在人体内完全适 应。大部分的病例都出现在海湾国家，特别是沙特阿拉伯。这表明病毒并非高度传染性，即便你接触过一些从沙特阿拉伯的人——哪怕他已经被感染——传染给你的 几率依然很低。大多数感染者都是在沙特阿拉伯的工作人员或者医院的病患，而且多是年长者。目前没有证据表明MERS可以在一般人群中传播。客观的说法是： 不能在人与人之间持续传染，密切接触者风险较大。
☆ 致死率有差异
SARS综合致死率约为14%(对65岁以上人群致死率高达50%以上)。相比MERS的综合致死率要高得多，一直在30%上下波动。MERS能引起非常严重的肾衰竭，通常被认为是致命的主要原因。
既然MERS病程更快、致死率更高，很多人担心，MERS会不会出现像SARS一样的全球流行?
从目前的MERS暴发情况上来看，不太可能。
首要原因是上文所述，MERS的传染性不如SARS，自2012年该疾病开始流行以来，大部分新病例出现在沙特西部的吉达地区，目前没有证据表明MERS病毒本身发生了变异，虽然报告发病数急剧增加，但还主要集中在中东地区的几个国家，没有广泛扩散。
其次，病毒之所以在吉达肆虐，也是因为医院缺乏卫生学知识，至少是没有做好充足的防护，从而加速病毒在患者和医护人员间的传播，沙特阿拉伯的卫生部长 也因此被解职(他至少漏报了113起病例，其中有92人现已死亡)。客观来说，只要医院在处理原因不明的呼吸疾病患者时，采取严格的感染预防与观察措施， 病毒的传播就能够被遏制住。
